AMINOÁCIDOS

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AMINOÁCIDOS

Algunos son modificados posteriores a la produccion. Cuando ya está la proteina se ejercen cambios durante  su plegamiento, durante su procesamiento o incluso despues de todo eso para constrituir unos aminoacidos.

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PATRON DE IONIZACION DE LOS AMINOÁCIDOS

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Sustancia ionizable: Aquella capaz de ganar o perder un proton, a un ph especifico en el cual la base y el acido conjugao tienen la misma concentracion.

Los aminoacidos son sustancias diproticas: Tienen un grupo carboxilo (posee pk localizado en valores de pH ácido ) y un grupo amino (posee pk localizado en valores de pH básico ), ambos ionizables.

Aun pH ácido( suficiente para mantener protonado a cualquier grupo capaz de recibir un protón): Tanto el carboxilo como el amino están protonados , pero solo el amino tiene carga

En la medida en que haya un pH mas bajo y por ende mayor disponibilidad de protones, mas grupos protonbales, es mas favorable que la carga neta de toda la molecula se vuelva positiva, dado que se acumulan protones unidos a la molecula. 

Ej: un proteina que tiene 1000 grupos protonables, muchos de estos grupos pueden ser amino de la lisina y la arginina que son grupos protonables. Se van acumulando cargas positivas por los aminos que estén protonados, pero por los carboxilos no, los carboxilos protonados no dan carga electrica.

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Si se sube el OH, en este caso por la adicion de NaOH (Titulacion normal por compuesto multiprotico 2): Se comienzan a tomar protones de aquel grupo quimico que mas facilmente suele proton (es decir, del acido). En la medida que el acido entrega protones, la base (es decir el OH) que va entrando irá tomando protones sin que se note un cambio derastico del Ph.

El pH no cambia en tanto haya moleculas de aminoacido disponibles para entregar los protones.

En el momento en que se acaba totalmente el grupo acido (es decir, todos los aminoacidos pierden todos los protones que se podian), en ese momento se llega a un punto de equivalencia (es decir,  punto en el que se agregado la cantidad de base necesaria para agotar el primer grupo ionizable).

Después de alcanzar el punto de equivalencia, cualquier cantidad mínima de base causa un cambio drástico en la cantidad del pH.

Punto isoeléctrico: Punto intermedio, promedio entre 2 pK de una molécula. Ojo: No es un punto medio en cuanto a concentración. Sirve para clasificar los aminoácidos. Permite establecer que un aminoacido tiene cargas balanceadas. Es un pH en el cual seguramos que tenemos una máxima concentracion del switterion.

A medida que se va desprotonando el primer grupo desprotonable (el acido), se va cambiando desde la forma protonada (carga +), a la forma mas dipolar (carga 0), hasta alcanzar la forma mas desprotonada (carga -).

La forma dipolar o carga switerion: Se forma gracias a que como el acido perdió un protón, ahora el acido gana una carga negativa. Y dado que el grupo amino conserva la carga como venia, la molécula finaliza con cargas balanceadas (es decir con una carga de cero.)

Si seguimos añadiendo base, alcanzamos una segunda zona de titulación en la cual comenzará a perder su proton el grupo amino.

La carga eléctrica de la molécula cuando se han superado los 2 Pk, será en su mayoría una molécula con carga desprotonada.

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La alternancia de concentraciones:

• La especie totalmente protonada, es máximo su concentracion cuando el Ph es inferior al pK. El punto en el que el pH es inferior al pK es en el punto equivalencia de concentraciones con la siguiente especie química (en este caso, el switerion). En este caso la especie que esté en la izquierda 1 es el ácido, y la especie que esté en la derecha 2 es la base conjugada.

Si se sigue añadiendo NaOH se alcanza un punto en que la especie switerionica empieza a perder su protón y a ser intercambiada por la especie totalmente desprotonada

El Aminoacido es un compuesto diprotico ya que tiene 2 grupos ionizables: el grupo aminoalfa y el grupo carboxilo alfa, por lo tanto, tiene 2 puntos de equivalencia.

Según el pH en que nos encontremos, tendremos una mayor cantidad de una de las especies, pero ojo las otras sustancia nunca llegan a cantidad cero, solo se reducen a cantidades muy pequeñas.

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VALORES DE PK DE TODOS LOS AMINOÁCIDOS. Aquí encontramos los valores del Pk del carboxilo alfa y el pK del amino alfa de estos aminoácidos. También encontramos el valor del pK concenso, es decir el valor Pk de los grupos laterales de estos aminoácidos (ej: del acido Licicina y la Arginina)

El calculo de la carga neta de un péptido: Excluye todos los grupos que estén participando en enlaces peptídicos (que en este caso son los grupos amino y carboxilo, los cuales no estan disponibles para ser ionizados), por ello, solo estarían contribuyendo a la carga los grupos amino y carboxilo alfa de los aminoácidos de los extremos y todos los que sean ionizables dentro de la cadena.

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