Simulador De Pcr

ESTUDIO DE UNA ANOMALÍA DE CARÁCTER GENÉTICO MEDIANTE TÉCNICAS DE BIOLOGÍA MOLECULAR

INTRODUCCIÓN.

Hemos visto las técnicas más relevantes de Biología Molecular de uso en los laboratorios de Diagnóstico Clínico.

Vamos a proceder al estudio de una patología de carácter genético en la que se sospecha que hay alternaciones en la secuencia del gen que codifica para una proteína, la Amelogenina.

Para ello procederemos a la realización de un estudio de PCR, para que en base a los resultados podamos caracterizar la patología tanto a nivel genético como fenotípico.

Además procederemos a la determinación de las condiciones elementales de análisis de PCR empleados.

1)Navega por el portal del NCBI y comprueba las múltiples aplicaciones que tienen los bancos de información que dispone. http://www.ncbi.nlm.nih.gov.

2)Procede a la realización de la simulación del análisis de PCR que está en el sitio http://www.cybertory.org/simulators/index.html. Las condiciones de análisis son:

Template: Human reference genome. El Resto de parámetros serán los mismos que por defecto indica el programa. Para realizar la PCR dar a la opción “run reaction y show gel”. Captura el resultado electroforético e Interpreta los resultados (nota los cebadores o primer son secuencias promotoras específicas para este gen que se une a las secuencias homólogas y permite así que la Taq polimerasa complete un ciclo. Existen dos el Amelogenin F (en sentido 5-3) y el Amelogenin R en sentido 3´-5`.

3)Ahora has lo propio con el individuo que supuestamente dispone de esta alteración. Los parámetros del ciclo serán Template: Individual Human Patien 7. El resto de parámetros son invariables. Interpreta la electroforesis.

4)Caracteriza a dicha proteína a nivel molecular ( secuencia de DNA,. secuencia de RNA, secuencia de aminoácidos), identificando las funciones y las implicaciones que tiene esa proteína, etc. Puedes basarte en los recursos que hay en la web del NCBI.

5)Identifica la secuencia de los promotores empleados en la secuenciación. Establece el procedimiento de la realización de la electroforesis.

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