Genética y genómica bacteriana
Enviado por enmanuelcornie • 22 de Marzo de 2023 • Ensayos • 323 Palabras (2 Páginas) • 35 Visitas
Genética y genómica bacteriana.
Tema 1: Genómica bacteriana.
- Reducción genómica – la podemos observar en bacterias endosimbiontes por ejemplo.
- DNA microarray.
Análisis metagenómico: análisis genómico directo de una mezcla de organismos heterogéneos.
Plásmidos: cromosoma extra, self-replicating piece.
Pseudogen: gen modificado en el cual hay una serie de nucleótidos que no se transcriben porque hay regiones faltantes o alteradas.
El cromosoma procariota es una molécula compactada asociada a proteínas.
Because prokaryotic DNA can interact with the cytoplasm, transcription and translation occur simultaneously.
[pic 1]
Electroforesis de campo pulsado.
Pirosecuenciación
Secuenciación Sanger
Secuenciación ilumina
Nanopore sequencing. Se coloca emolina.
PacBio (Pacific Bioscience).
Base de datos: GOLD: Genomes online.
Firmicutes-Grampositivos / Proteobacterias-Gramnegativas
1995: publicación de los primeros genomas.
Genes conservados: no son iguales, tienen un nivel de similitud muy alta.
Genes ortólogos: ácidos nucleicos son similares entre sí debido a que presentan un mismo origen evolutivo.
Con la aparición de la metagenómica se podía secuenciar a partir de una muestra ambiental y no solo de una muestra pura cultivada en el laboratorio.
Given the estimates indicating that less than 0.1% of prokaryotes represented in most environments can grow in culture [49, 50], metagenomics ushered in a revolution in microbiology by allowing unbiased, genome level surveys of microbial diversity.
La transferencia genética horizontal es el motor de la evolucion de las procariotas.
Pangenoma: conjunto completo de genes de todas las cepas que forman un clado filogenético. En otras palabras, un pangenoma es la unión de todos los genomas de los organismos que pertenecen a un mismo clado.
EL GENOMA BACTERIANO
En promedio una proteína tiene 300 aminoácidos. Hay de 1,000 y de 100. Si tiene 300 aminoácidos tiene 900 nucleótidos.
1 kb = a 1 proteína aprox.
Regla universal: Genomas de bajo pesos molecular son ricos en A+T.
G+C=
- pb = pares de bases (un par de bases mide alrededor de 3,4 Åmstromg)
- kb = mil pb
- Mb = un millón de pb
- Gb = mil millones de pb
GENOMA -> TRANSCRIPTOMA -> PROTEOMA.
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