“PPA 2: Caracterizacion genética en base a el gen cytb del grupo taxonómico Haliaeetus”

[pic 1][pic 2]UNIVERSIDAD AUTONOMA DE NUEVO LEON

          FACULTAD DE CIENCIAS                BIOLOGICAS

Lic. En Biotecnologia Genomica

Evolucion y sistematica

“PPA 2: Caracterizacion genética en base a el gen cytb del grupo taxonómico Haliaeetus”

Jordan Gabriel Coronado Gallegos

1548543   Gpo: 412

Cd. Universitaria, San Nicolás de los Garza, N.L. a 19/10/2015

Introducción

El género Haliaeetus de la familia Accipitridae también se les conoce burdamente como pigargos pues son aves accipitriformes. Este clado de aves de presa o rapaz (diurna) osease que caza presas para su alimentación, usan su pico y patas afiladas para llevarlo a cabo, estos tienden a ser grandes y potentes para desgarrar carne y así alimentarse, además de la gran fama que tienen todas las águilas por poseer una visión excepcional al momento de buscar su alimento, algunas de sus especies se ha demostrado y estudiado que prefieren radicar o vivir cerca de ríos, lagos y costas marinas como lo marca claramente la raíz etimológica del nombre del genero ”Haliaeetus: águila pescadora.

Protocolo

Para conseguir las secuencias y alinerlas correctamente se siguió un protocolo establecido, todo esto para comparar a nuestros organismos y al final ver la similitud en cuanto a el gen cytb y en un futuro establecer un cladograma sobre nuestros organismos.

1.- Buscar en la base de datos NCBI el gen con el género a encontrar (Haliaeetus AND cytb)

2.- Elegir los que se necesitan y oprimir “display settings” y fasta para que nos de solo esa información (nucleótidos) después presionamos el botón “Send to” del lado derecho de la pantalla y seleccionamos las opciones de “Complete record”, en Choose Destination “File”, Format “FASTA” y Sort by “Default order” para finalmente presionar el botón Create File.

3.- Despues se abrió el programa MEGA para alinear, y el primer paso fue Align -> Edit/Build Alignment  y se eligio nuestras secuencias previamente guardadas.

4.- Se alineo la secuencia con los pasos Alignment > alignment by muscle.

5.- Se cortan los GAPS de las secuencias para posteriormente guardarlo.

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Referencias

1.- J. W. Schoen and E. Dovichin, “The Coastal Forests and Mountains Ecoregion of Southeastern Alaska and the Tongass National Forest” 1era Edicion, The nature conservancy ed, 2007, Alaska, EUA.

2.- NCBI Database (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/?term=Haliaeetus+AND+cytb)

Consultado: 19/10/2015.

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