Secuenciación masiva

Como se mencionó en la plática, la metagenómica es el estudio directo de un conjunto de

genomas, correspondiente a una comunidad microbiana para determinar algunas de sus

características, sin la necesidad de realizar un aislamiento de dichas especies, sobre todo

ya que tan solo un 1% de los microorganismos conocidos son cultivables, y gracias a la

aplicación de las ciencias ómicas, el día de hoy es posible disponer de información

taxonómica y metabólica, proporcionando la posibilidad de conocer genes que les otorgan

funciones y características específicas y de gran interés a las comunidades microbianas.

Hoy en día la metagenómica ha sido empleada en el análisis de ambientes extremos,

tales como ambientes con abundante calor, halófilos, acidófilos, subterráneos y demás

condiciones extremas a lo largo del territorio de4 la tierra, donde cualquier otro organismo,

sin las características especiales que tienen dichos microorganismos de interés

microbiológicos, tienen nulas posibilidades de vida.

Algunos de los ejemplos expuestos a lo largo de la charla; involucran el estudio de

organismos que cuentan con genes que codifican para mecanismos de resistencia y por

ello existe la posibilidad de transferencia de dicha resistencia; por lo cual al combinar la

bioquímica, y otras disciplinas es posible entender mejor los ciclos microbianos, y obtener

beneficios biotecnológicos, tales como el uso de organismos extremófilos en el desarrollo

de detergentes de uso doméstico; que permiten el uso de los biocatalizadores o enzimas

naturales que éstos organismos poseen para eliminar manchas a temperaturas bajas,

además de ofrecer la posibilidad de producción de la enzima gamma lactamasa; que es

importante para el desarrollo de fármacos como el abacavir, que es usado para el

tratamiento de VIH, mientras que en el área de energías también se han encontrado

ciertas alternativas a los combustibles fósiles, además de ofrecer la capacidad de

radioprotección al personal que se encuentra en constante exposición debido a su área

laboral.

Uno de los proyectos que más llamó mi atención fue el tratamiento de humedales

contaminados por drenajes ácidos de minas por metales pesados (Cu, S y Zn), lo cual

afecta a las zonas cercanas, ya que acidifican el medio (pH=3.2), sin embargo a nivel

microbiano ha encontrado que las plantas interactúan con los metales, reteniendo

contaminantes; añadiendo gracias a investigaciones posteriores que la combinación de

plantas y bacterias específicas proporcionan una mejor y más rápida limpieza;

encontrando que las bacterias tienen distintos genes dependiendo de la profundidad del

suelo, y éstos están ligados con retención de metales, condicionados a la presencia de

fuentes de carbono, funcionando incluso las bacterias anóxicas.

En conclusión la aplicación de las ciencias ómicas se encuentra presente en todas las

ramas de la biotecnología ya que permite el conocimiento del genoma de ciertos

organismos de interés por medio de ciertas herramientas bioinformáticas, asegurando la

posibilidad de avanzar en nuevas áreas de investigación.

ANÁLISIS DE LIBRERÍAS CON TECNOLOGÍAS DE ELECTROFORESIS

CAPILAR Y dPCR (PCR digital)

La Plataforma QIAxcel, integra diversos elementos tales como transiluminador, cámara de

electroforesis y fotodocumentador en un mismo equipo, son el objetivo de realizar un

análisis de DNA tomando en cuenta su tamaño y concentración además de RNA,

permitiendo la evaluación de la integridad del mismo, éste equipo cuenta con cartuchos

listos para correr muestras sin la necesidad de la preparación de geles,

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