LABORATORIO DE TIPOS DE MUESTRAS

FASES DE EXÁMENES DE LABORATORIO

1. Fase preanalítica: En esta etapa se toman y se transportan las muestras: Etapa dirigida por personal de salud.
2. Fase analítica: En esta etapa se identifican a los microorganismos en el laboratorio: Etapa dirigida por personal de laboratorio.
3. Fase postanalítica: En esta etapa se prepara el informe de resultados y así el médico lo recibe y lo interpreta: Etapa dirigida por personal de laboratorio

RECOLECCIÓN DE MUESTRAS

Tiene como objetivo identificar al microorganismo infeccioso a través de sus características fisiológicas o genéticas, con el objetivo de guiar el tratamiento para una resolución adecuada de una patología infecciosa.

ANTES DE TOMAR LA MUESTRA ES PRIMORDIAL:

• Tener uno o varios diagnósticos presuntivos
• Indicar localización del proceso
• Comunicar nuestras necesidades al equipo del laboratorio
• Trabajar en equipo

• Tener uno o varios diagnósticos presuntivos: esto va a guiar dónde queda localizada la infección, entonces podemos tener un diagnóstico presuntivo, por ejemplo, pienso que es una bacteriemia, pienso que es infección de vías urinarias y de esa manera nosotros podemos localizar donde está el proceso infeccioso y recolectar la muestra de acuerdo a ese sitio.

También es importante comunicar nuestras necesidades al equipo de laboratorio, es decir, no solamente enviar un pedido al laboratorio, sino también indicar que es lo que yo espero, qué es lo que necesito, por ejemplo, decirle yo quiero saber si puedo utilizar este antibiótico; o quiero que me confirme si es que este antibiótico va a ser efectivo en mi paciente. Se resuelve conversando con el personal de laboratorio y siempre trabajar en equipo, en ocasiones nos toca adelantar el tratamiento antibiótico porque el paciente así lo requiere, por ejemplo, en una sexis.

METAS DE LA OBTENCIÓN DE MUESTRAS

• Mantener viable a los microrganismos o sus partes
• Evitar la contaminación de la muestra, es decir, que no existan agentes externos y nos hagan tener un diagnóstico equivocado.

ASEPSIA: Todos los métodos que se van a usar para evitar la contaminación de la muestra.
ANTISEPSIA: Inhibir o eliminar microorganismos, sobre todo disminuir la carga de microorganismos que no queremos que contaminen nuestra muestra.

TIPOS DE MUESTRAS

1. Con microbiota: inicia con la remoción de la materia orgánica que puede interferir con la adecuada recolección de las muestras o que pueden competir con el patógeno durante su almacenamiento y análisis. En estos sitios se debe realizar una limpieza (limpiar), es decir, seguir un proceso mecánico de remoción de materia orgánica sin uso de detergentes o desinfectantes que pueden matar a nuestros patógenos. Por ejemplo, para la toma de muestra de la faringe se debe lavar cuidadosamente los dientes con agua y un cepillo, sin pasta de dientes antibacterial, sin enjuagues bucales antibacteriales que pueden destruir a los microorganismos de la boca.
   Limpiar (mecánico)-----Tomar muestra (asepsia)
2. Sin microbiota “estériles”, no deben haber ni bacterias ni virus en ese lugar, pero no están totalmente estériles porque hay células humanas. Para acceder a estos sitios estériles se debe atravesar una estructura anatómica como la piel o la mucosa que tienen microbiota cuyos microrganismos pueden contaminar nuestra muestra llevándonos a un resultado erróneo.

Limpiar (mecánico)----Desinfectar acceso (aplicar agentes desinfectantes en la piel, antisepsia) (Químico) -------- Tomar la muestra (Asepsia).

HEMOCULTIVOS

Para tomar estas muestras se debe acceder a través de la piel, la piel tiene microbiota por eso se debe limpiar con una gasa, jabón, ir removiendo el sucio (1), después se aplica un agente desinfectante compatible con la piel como el etanol, la clorhexidina, pasando una sola vez por el sitio de acceso.

Para conseguir una muestra adecuada se debe usar recolectores estériles para evitar la contaminación cruzada que se deriva de la mala preparación del material de recolección, se debe realizar un lavado de manos clínico con un jabón antibacterial y colocarnos guantes.

Cuando se toman muestras de sitios estériles es muy importante realizar la limpieza del sitio de acceso con un par de guantes limpios, desecharlos, volver a lavar las manos, portar una barra quirúrgica, una mascarilla y unos guantes estériles nuevos e insumos para evitar la contaminación de la muestra.

Los análisis microbiológicos son muy sensibles y erróneamente podrá clasificar al organismo contaminante con el patógeno, perdiendo tiempo, dinero y sobre todo el tiempo crucial para la vida del paciente.

¿POR QUÉ ES IMPORTANTE IDENTIFICAR AL AGENTE CAUSAL, SI MEJOR LE PUEDO ADMINISTAR UN ANTIBIÓTOCO O VARIOS DE AMPLIO ESPECTRO Y YA?

• Creencia errónea
• Si no conoces a tu enemigo no podrás luchar contra él.
• Si piensas jugar a ciegas con los antibióticos, estás jugando con la vida de tu paciente y mal gastando el tiempo que necesita para frenar el proceso infeccioso.
• El 40% de pacientes que fallecen con una infección bacteriana tuvieron como causa real de muerte el retraso de un tratamiento adecuado, es decir, el médico indicó a ciegas el antibiótico y por ello la infección avanzó sin control, otra causa de muerte es la combinación de medicamentes de amplio espectro produjo una alta toxicidad y los pacientes fallecen por complicaciones relacionadas a los efectos adversos de esas combinaciones de antibióticos. Si se le administra medicamentos de amplio espectro, el paciente muere de una toxicidad prematura, innecesaria y mortal.
• El diagnostico microbiológico es lento, pero no es excusa.

MUESTRAS DE SITIO ESTÉRILES:

• Sangre
• LCR
• Líquido sinovial
• Orina de chorro medio

MUESTRAS DE SITIO CON MICROBIOTA:

• Orofaringe
• Heces fecales
• Tracto respiratorio superior e inferior
• Tejidos balndos.

MUESTRA DE MALA CALIDAD/QUE NO ES DE BUENA CALIDAD

• Falsos negativos: que no se va a poder encontrar el agente causal de la enfermedad, de la infección (mala toma de muestra).
• Falsos positivos: se encuentra un microrganismo, una bacteria, pero este no esta relacionado con el proceso de infección del paciente. Ocurre porque no se realizó un correcto proceso de limpieza, de desinfección de la zona antes de tomar la muestra.

OBTENCIÓN DE MUESTRAS DE SITIOS ESTÉRILES

Si se encuentra bacterias en estos sitios, estas han invadido, colonizado y que pueden ser potencialmente patogénicas.

• Consideraciones generales:

• Lavado de manos
• Colocación de EPP (mascarilla y guantes)
• Identificación del sitio del que se va a tomar la muestra estéril
• Limpieza (con agua y jabón o torunda) y desinfección (clorhexidina o alcohol al 70%)
• Material estéril, para no contaminar.

HEMOCULTIVO  

Detección de bacteremia y fungemia.

Está asociada en un 20 a 50% de muertes en los hospitales

Materiales para punción venosa:

• Jeringuilla
• Aguja tipo mariposa en lugar de jeringuilla
• Frascos para hemocultivo: suelen tener inhibidores de antibióticos

Pediátrico: volumen de sangre de 1 – 3 ml

Hongos: volumen de sangre de  1 – 5 ml

Más usados:

Aerobio: volumen de sangre de 8 – 10 ml

Anaerobio: volumen de sangre de 8 – 10 ml

CONSIDERACIONES HEMOCULTIVO

• Muestra antes de antibióticoterapia: poco frente, ante eso se debe tomar la muestra cuando hay mínima concentración del antibiótico, previo a la siguiente dosis.
• Intervalo de tiempo 20 – 60 minutos:
• Sitios de puncion siempre diferentes:
• No cercana a una vía de suero: porque aquí la sangre va a estar diluida y es posible que no se encuentre a la bacteria circulante
• Orden de extracción: primero las prubeas de hemo,
• Volumen de sangre
• Retrocultivos: la sangre se extrae de vías venosas centrales, en casos de bacteremias relacionadas a los catéteres
• Subcultivos: tinción gram y siembra (a 35 grados para medir turbidez)
• Bacterias que con frecuencia se encuentran son: enterobacterias, Staphilococcus aureus, streptococcus pneumoniae y pyogenes; Pseudomona aeruginosa y candida sp.

UROCULTIVO / MICROORGANISMOS EN ORINA

• Técnica chorro medio: se pide al paciente que se realice un lavado externo de los genitales sólo con agua y si lo realiza con jabón, debe retirarse por completo.

Cuando inicia la micción no se toma el primer chorro, sino el chorro medio.

• Sonda vesical: se denomina así cuando se utiliza este dispositivo, el mismo se coloca directamente en la vejiga para hacer una evacuación orina cuando el paciente no puede hacer la acción por sus propios medios. El extremo 5 es el que se inserta en la vejiga y en la parte 4 hay un globo que se infla externamente mediante el punto de acceso 1 que se infla y mantiene fijo a esta sonda. No se recomienda usar sondas que tengan mucho tiempo, puesto que, a los 30 minutos a 1 hora, la sonda ya es colonizada por bacterias, por eso se cambia, se desinfecta y se procede al procedimiento.
• Recolector: tiene una parte adhesiva, que se fija en la parte posterior de los genitales en hombres y mujeres y se recolecta la orina, luego se pasa a un frasco y este es el que se lleva al laboratorio de bacteriología, en esta técnica hay riesgo de contaminación de la muestra.
• Punción suprapúbica: se la realiza por urólogos, nefrólogos, emergenciólogos pediátricos, para esto se retira la orina punzando directamente en la vejiga. Lo que generalmente encontramos en estas muestras son enterobacterias, stephilococcus aureus, Pseudomona aeruginosa, entererococcus sp candida.

LÍQUIDO CEFALORAQUÍDEO (LCR)

• Punción lumbar
• La aguja se coloca intervertebralmente
• Posición de cúbito lateral con las rodillas hacia su pecho
• Sitio de punción: L3-L4, L4-L5 o L5-S1
• Diagnosticar: meningitis infecciosas, encefalitis viral aguda y hemorragia subaracnoidea
• También se puede recolectar estas muestras en derivaciones externas e internas, es decir, se puede obtener a través de un catéter ventricular o lumbar, sin embargo hay mucha probabilidad de contaminación.
• Principales patógenos: 
  Neonato y menor de 2 meses: S. agalactiae, E. coli, Listeria monocytogenes.

Menor de 10 años: streptococcus pneumoniae, Neisseria meningitis
Adulto: S pneumoniae, Neissseria meningitis
Adulto mayor: bacilos gram negativo, Listeria monocytogenes.

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