Replicación del DNA

Todos los telómeros terminan en TTG

Telomerasa: pone el complementario de la propia secuencia que lleva. Va a extender el telómero

Se reprime el gen para las telomerasas y cuando ya no hay en las células pues el telómero se queda más corto. El cromosoma pierde estabilidad física y la RNAPol no reconoce promotores.

Genes subteloméricos

Mecanismos naturales que pueden amenazar la integridad del DNA:

• Conjugación: formación del pili
• Transformación: hay DNA libre de células lisadas y otras células lo pueden introducir.
• Transducción: a través de virus que agarran DNA de una cel y lo ponen en otra. La cel receptora no puede impedir el ingreso del DNA, pero si puede evitar que se establezca y tenga éxito.

F+ o macho, es el plásmido, las receptoras son F- o cepas hembra. Cuando el cromosoma se inserta se llama Hfr (High frecuency recombination)

Operon Tra

Episoma: Cuando el plásmido F se inserta en el cromosoma

Si se inserta o no, depende de condiciones ambientales como estrés nutrimental

Estudiar el circulo rodante: https://en.wikipedia.org/wiki/Rolling_circle_replication

Introducción:

Mismatch repair (MMR):

Dimeros de timina: se forma un enlace covalente entre los grupos metilo de las dos timinas. Se acorta la distancia entre las dos timinas.

La reparación se da por escisión y síntesis.

https://www.youtube.com/watch?v=9DRnoi8gfMU

https://www.youtube.com/watch?v=aT0PcymP9Gc

Gap: hueco de más de dos bases

Deleción: cuando falta 1 sola base

Depende de la cantidad de material genético dañado:

Very short – 6 a 12 bases

Short – <100 bases

Long – >100 bases

1. Dam modifica adeninas que estan en la secuencia GATC-CGAT.

Dcm metila citocinas methylates the internal (second) cytosine residues in the sequences CCAGG and CCTGG (1,3) at the C5 position.

• Complejo Hsd (Host specificity) modifica adeninas formado por 3 proteinas:

• S da la especificidad
• M metila (su acción depende de S)
• R restricción/corta (Su acción depende de M) – actúa si no está metilado

El fenotipo de lo anterior se conoce como m+r+

Una cepa S- no podría realizar modificaciones porque no puede reconocerlo

Una cepa R- si podría modificar pero no va a poder cortar

Una cepa M- ni metila ni corta

Si está metilado (como recién replicado) no le hará nada. Si está hemimetilado lo va a metilar. Si no está metilado lo va a destruir.

1. Endonucleasas (enzimas de restricción)

En la misma molécula hay especificidad y corte; en otra molécula diferente el metilado. Ampliamente distribuidas en el mundo procariota. Son DNA de doble cadena secuencia dependiente. Reconocen una secuencia MUY específica. Normalmente son palíndromes (de 4 o de 6 bases).

Palíndrome: secuencia que tiene la misma secuencia de 5´a 3´en ambas hebras.

A las enzimas de restricción se les nombra de acuerdo con dos cosas:

1. El organismo del que proviene y la cepa
2. Y el número de enzima en ser caracterizada

Ej. EcoRI, BamHI, PstI, BclI (es suceptible a la metilación)

Primera letra del género y dos de la especie

Cepa

Numero cronológico de descubrimiento de la enzima

endonucleasas suceptibles a la metilación

5 por Dam y 5 por Dcm

BclI

Cuando el origen se replica queda hemimetilado.

schizoisomeros: dos endonucleasas que reconocen exactamente la misma secuencia pero que provengan de diferentes organismos

1. Sistema asimetrico de una secuencia de 7 bases pobremente disperso en la naturaleza

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