Proteína de electroforesis en geles de agarosa

La poliacrilamida es uno de los geles utilizados con más frecuencia para realizar técnicas de electroforesis, las cuales tienen como objetivo realizar un análisis y/o separación por carga y tamaño molecular de los fragmentos de aminoácidos o nucleótidos que componen muestras escogidas de proteínas o ácidos nucleicos como el ADN o el ARN respectivamente.1

La acrilamida es un compuesto orgánico de tipo amida.

Es blanca, inodora y cristalina, soluble en agua, etanol, éter y cloroformo. Se emplea en la fabricación de papel, extracción de metales, industria textil, obtención de colorante y en la síntesis de poliacrilamidas.

Electroforesis en gel de poliacrilamida (PAGE) se ha convertido en una técnica popular para separar las proteínas y ácidos nucleicos a causa de su "alta resolución, facilidad de uso, y flexibilidad. PAGE se puede realizar utilizando las proteínas nativas (no desnaturalizado) o desnaturalizado. PAGE sodio dodecil sulfato o SDS-PAGE se utiliza ampliamente como un sistema para separar las proteínas desnaturalizadas. Aunque hay muchas variaciones en las formulaciones para geles de poliacrilamida, la química básica se ha mantenido constante en el tiempo. Al comprender los conceptos básicos de la formación de gel de poliacrilamida, se puede ajustar las condiciones para optimizar mejor un sistema dado o protocolo.

Proteína de electroforesis en geles de agarosa

La electroforesis de proteínas en geles de agarosa es un enfoque alternativa al uso de geles de poliacrilamida y proporciona varias ventajas. Los geles se pueden ejecutar con un sistema vertical o un sistema horizontal y diferencia de los geles de poliacrilamida, geles de agarosa se puede utilizar eficazmente para separar las proteínas más grandes de 600.000 kDa.

Ventajas

• Separe alto peso molecular (> 600.000 proteínas kDa)

• Fácil de preparar y manejar

• La recuperación eficiente de las proteínas

• Las proteínas extirpados se puede utilizar para inmunizar a los animales directamente para la producción de anticuerpos

• No es tóxico

Ácidos nucleicos

En los ácidos nucleicos la dirección de migración es del electrodo negativo al positivo, y esto es debido a la carga negativa presente en el esqueleto azúcar-fosfato. En los fragmentos de ADN dobles (con estructura de doble hélice) la velocidad de migración es inversamente proporcional a su tamaño. En fragmentos simples de ADN y ARN (una sola cadena), dichas moléculas tienden a plegarse de forma compleja y a migrar de forma

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