Transcripción

Crecimiento organismal adecuada y el desarrollo dependen del tiempo, la ubicación y el nivel de la proteína-codificación y transcripción de genes RNA regulatorio por la ARN polimerasa II (pol II). Los defectos en estos parámetros de transcripción pueden resultar en una variedad de fenotipos, incluyendo cambios de destino celular y la letalidad. Por lo tanto, mucho esfuerzo ha ido a la determinación de los mecanismos que regulan la transcripción de genes importantes para el desarrollo. Estos esfuerzos se han centrado en los mecanismos que están mediadas por las secuencias de ADN que actúan en cis y factores de proteínas que actúan en trans. Algunas señales que regulan la transcripción están cableados a través de genes que ocurren comúnmente genómica elementos de la secuencia de ADN que actúan como sitios de unión para la maquinaria de transcripción. Estos elementos se clasifican como potenciador, promotor proximal, o elementos básicos promotor en base a su ubicación dentro de los genes y sus proteínas de unión correspondientes (Fig. 1A). Enhancer y elementos de promotor proximal están ambos unidos por proteínas de unión a ADN específicas de secuencia (comúnmente llamados factores de transcripción), pero estos elementos se encuentran en diferentes ubicaciones en relación con el sitio de inicio de la transcripción de genes (TSS). La ubicación de los elementos potenciadores varía mucho entre los genes y puede haber muchas kilobases aguas arriba o aguas abajo de la SAT, en tanto que elementos de promotor proximal suelen limitarse a un par de cientos de pares de bases de la SAT. Por el contrario, los elementos básicos promotor están sujetos a factores de transcripción basal y se encuentran dentro de las zonas de ~ 100 pb centradas en el SAT. Iniciación de la transcripción de Pol II se refiere, en parte, por la transcripción basal factores TFIIA, TFIIB, TFIID, TFIIE, TFIIF y TFIIH que montar en promotores fundamentales (Thomas y Chiang, 2006). Factores de transcripción basales se llaman así porque se dirigen un nivel de transcripción in vitro en ausencia de factores de transcripción adicionales bajo o basal. Esto es en contraste con un nivel de transcripción in vitro que se dirige por las actividades combinadas de factores de transcripción basal y adicionales más alto o activado. Los estudios bioquímicos indican que los factores de transcripción basal reúnen en promotores fundamentales de una manera definida, comenzando por la unión a los elementos básicos promotor. El ejemplo original y por excelencia es la unión de la proteína (PDD) subunidad de unión a TATA de TFIID al elemento de caja TATA, que nuclea montaje de TFIIA y TFIIB, seguido por el conjunto de TFIIF y Pol II como un complejo pre-ensamblado, y culminando en el montaje de TFIIE y TFIIH. El impulso detrás de esta crítica proviene de los informes recientes que implican complejos TFIID y elementos básicos promotor como vital para la regulación de la transcripción del desarrollo. Este hallazgo es probable que sea sorprendente para aquellos que no siguen de cerca la literatura de la transcripción porque la vista de libro de texto es que la regulación de la transcripción del

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