ESTRUCTURA DEL ADN Y ARN, ESTRUCTURA DEL GEN

ESTRUCTURA DEL ADN Y ARN, ESTRUCTURA DEL GEN.

STRUCTURE OF DNA AND RNA, STRUCTURE OF THE GENE

EDUAR VELASQUEZ ISAZA

UNIVERSIDAD FRANSCISCO DE PAULA SANTANDER OCAÑA, 2018 V SEMESTRE BIOMOL

RESUMEN:  En este pequeña practica podemos comprender, interpretar, analizar los genes de un eucarioto que en ella encontramos intrones, exones, localización, números de exones para determinar el tipo que corresponde; Aunque existen programas que se centran en alguna de las estrategias de predicción mencionadas más arriba, y que sirven para analizar o identificar una propiedad o motivo específico, existen muchos programas para identificar genes que combinan varios sistemas.

A continuación, presentaremos un tipo de gen con sus respectivas características, con su Arnm y una identificación de un Blast con su respectivo gen y especie

ABSTRACT:  In this small practice we can understand, interpret, analyze the genes of a eukaryote that in it we find introns, exons, localization, numbers of exons to determine the corresponding type; Although there are programs that focus on some of the prediction strategies mentioned above, and that serve to analyze or identify a specific property or motive, there are many programs to identify genes that combine several systems.

 Next, we will present a type of gene with its respective characteristics, with its Arnm and an identification of a Blast with its respective gene and species.

INTRODUCCION

Los ácidos nucleicos, y el ADN en particular, son macromoléculas clave en la continuidad de la vida. El ADN lleva la información hereditaria que se trasmite de padres a hijos y proporciona las instrucciones sobre cómo (y cuándo) hacer muchas proteínas necesarias para construir y mantener en funcionamiento células, tejidos y organismos.

La manera en que el ADN lleva esta información y cómo la usan células y organismos es compleja, fascinante y bastante sorprendente, y la exploraremos con más detalle en la sección de biología molecular

Los exones son parte de DNA que se convierten en el ARN de mensajero maduro (mRNA). el proceso por el cual la DNA es utilizada mientras que un patrón para crear el mRNA se llama transcripción. Este mRNA entonces experimenta otro proceso llamado la traslación donde el mRNA se utiliza para sintetizar las proteínas, vía otro tipo de ARN llamado molécula de la transferencia

Los intrones son parte de los genes que no cifran directamente para las proteínas. Los intrones pueden colocar de tamaño a partir de los años 10 de pares bajos a 1000's de pares bajos.

PALABRAS CLAVES: INTRONES, EXONES, SILENCIADORES, CAP, NUMEROS DE EXONES

KEY WORDS: INTRONES, EXONES, SILENCERS, CAP, NUMBERS OF EXONS

OBJETVOS

• Reconocimiento de la estructura de ADN, ARN y genes en usando secuencias reales de ADN.
• Conocimiento de los Bancos de ADN mundial, repositorios de información de todas las especies secuenciadas y estudiadas:

National Center for Biotechnology Information: NCBI

The European Bioinformatics Institute: EMBL-EBI

DNA Data Bank of Japan: DDBJ

METODOLOGIA Y PROCEDIMIENTOS

Actividad

1. Realice la búsqueda un gen eucariota usando una de las fuentes vistas en la práctica y resalte todos los sitios de interés  del gen.  

Localización

Numero de exones

Enhancer (si los tiene)

Silenciadores (si los tiene)

Exones

Intrones

1. Realice la búsqueda de la secuencia de ARNm al mismo gen del punto anterior y resalte los sitios de interés:

Cap

Regiones codificantes (CDS)

Poli A

1. Realizando un Blast (Basic Local Alignment Search Tool) identifique a que gen y especie corresponde la siguiente secuencia:

> GCTCCCGAGGGATGCGTCCTAGGGGTGGGGAGGCAGGAAGGGGTGAATCCACACCCCCTCCACACAGTG

GGAGGAAACTGAGGAGTTCAGCCGTATTTTATCCAAGTAGGGATGTGGTTAGGGGAGCAGAAACGGGGGT

GTGTGGGGTGGGGAGGGTTCCGAATAAGGCGGGGAGGGGAACCGCGCACCAGCTTAGACCTGGGTGGGTG

TGTTCTTCCCCCAGGAGCGCACCTACATCCCGGAGGGACAGAGATACTCCATCCAGAACACCCAGGTTGC

CTTCTGCTTCTCTGAAACCATCCCGGCCCCCACGGGCAAGAATGAGGCCCAGCAGAAATCAGTGAGTGGC

AACCTCGGACCGAGGAGCAGGGGACCTCCTTCATCCTAAGTAGGCTGCCCCAGCTCTCCGCACCGGGCCT

GGGGCGGCCTTCTCCCCGAGGTGGCGGAGGTTGTTGGATGGCAGTGGAGGATGATGGTGGGCGGTGGTGG

CAGGAGGTCCTCGGGCAGAGGCCGACCTTGCAGGGCTGCCCCAAGCCCGCGGCACCCACCGACCACCCAT

CTGCCAGCAGGACTTGGAGCTGCTTCGCATCTCACTGCTCCTCATCCAGTCGTGGCTTGGGCCCCTGCAG

TTCCTCAGCAGAGTCTTCACCAACAGCTTGGTGTTTGGCACCTCGGACCGTGTCTATGAGAAGCTGAAGG

ACCTGGAGGAAGGCATCCTGGCCCTGATGCGGGTGGGGATGGCGTTGTGGGTCCCTTCCATGCTGGGGGC

CATGCCCGCCCTCTCCTGGCTTAGCCAGGAGAATGCACGTGGGCTTGGGGAGACAGATCCCTGCTCTCTC

CCTCTTTCTAGCAGTCCAGCCTTGACCCAGGGGAAACCTTTTCCCCTTTTGAAACCTCCTTCCTCGCCCT

TCTCCAAGCCTGTAGGGGAGGGTGGAAAATGGAGCGGGCAGGAGGGAGCTGCTCCTGAGGGCCCTTCGGC

CTCTCTGTCTCTCCCTCCCTTGGCAGGAGGTGGAAGATGGCACCCCCCGGGCTGGGCAGATCCTCAAGCA

GACCTATGACAAATTTGACACAAACATGCGCAGTGACGACGCGCTGCTCAAGAACTACGGTCTGCTCTCC

TGCTTCCGGAAGGACCTGCATAAGACGGAGACGTACCTGAGG

RESULTADOS

A) Oryctolagus cuniculus

LOCUS       AAGW02071942           15369 bp    DNA     linear   MAM 31-AUG-2009

DEFINITION  Oryctolagus cuniculus breed Thorbecke inbred cont2.71941, whole

            genome shotgun sequence.

ACCESSION   AAGW02071942 AAGW02000000

VERSION     AAGW02071942.1

DBLINK      BioProject: PRJNA12819

            BioSample: SAMN02953624

KEYWORDS    WGS.

SOURCE      Oryctolagus cuniculus (rabbit)

  ORGANISM  Oryctolagus cuniculus

            Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi;

            Mammalia; Eutheria; Euarchontoglires; Glires; Lagomorpha;

            Leporidae; Oryctolagus.

REFERENCE   1  (bases 1 to 15369)

  AUTHORS   Di Palma,F., Heiman,D., Young,S., Gnerre,S., Johnson,J.,

            Lander,E.S. and Lindblad-Toh,K.

  CONSRTM   The Genome Sequencing Platform, The Assembly Computation and

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