Alineamiento de secuencias
Enviado por Esther San Lucas • 24 de Octubre de 2023 • Ensayos • 435 Palabras (2 Páginas) • 28 Visitas
UNIVERSIDAD ESTATAL DEL SUR DE MANABÍ[pic 1][pic 2]
Creada mediante registro Oficial 261 del 7 de febrero del 200
Facultad ciencias de la salud
Carrera laboratorio clínico
Calificación | Carrera: Laboratorio Clinico | Fecha: 03/07/2021 | ||
Semestre: Septimo | Paralelo: B | |||
Apellidos y Nombres: | Tema: Objetivos de alineamiento y probabilidades de lectura | |||
FARIAS MACIAS OKI ALEJANDRO | SAN LUCAS QUIMIS ARIANA DAYANETH | |||
FRANCO MERCHAN YULI | SUAREZ NUÑEZ RICHARD JAIRO |
Sesión 7
Practica 6. GENSCAN.
Unidad temática II: | Alineamiento de secuencias |
Tema: | Objetivos de alineamiento y probabilidades de lectura. |
Objetivo: | Aplicar metodología bioinformática mediante los modelos ocultos de Markov para predecir genes utilizando la herramienta software GenScan. |
Instrucciones:
- Trabajar de forma grupal.
- El trabajo se registra en el componente de prácticas de aplicación y su calificación es de 30 puntos.
- Encontrar los datos necesarios mediante el análisis de la secuencia que se ha subido al classroom.
- Subir la tarea hasta las 12:00 pm del día sábado 3 de julio del 2021.
- Todos los integrantes del grupo deberán reportar la tarea.
- En el caso que no registre la tarea en el tiempo indicado se penalizara de acuerdo con el tiempo de retraso de entrega.
Modelos probabilísticos o Estocásticos utilizando GENSCAN
Realizar análisis de predicciones de genes mediante las siguientes instrucciones:
- Buscar una secuencia larga en Gquery Genoma “Genoma de Humamos o vertebrados”. (capturas y pantallas y la descripción de las mismas).
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- Analizar la secuencia con GenScan. (capturas y pantallas y la descripción de las mismas).
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- Realizar el análisis de los resultados obtenidos. (capturas y pantallas y la descripción de las mismas).
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- Se encontraron 2 genes en la secuencia
- En el Gen 1, es un gen de un solo exón, El codón de inicio fue en el 469 y el codón final fue de 1416 y tiene 948 caracteres, un marco abierto de 0 y su número de score es de 105.64
- En el Gen 2, 1 Inter el codón de inicio es el 3626 y el codón final es el 3456 y tiene 171 caracteres, un marco abierto de 2 y su número de Score es 9.95
- Hacer BLAST para obtener los homólogos de las proteínas predecidas. (capturas y pantallas y la descripción de las mismas).
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Se encontraron 100 secuencias homologas de proteínas
[pic 7]
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