BIOQUIMICA. AGUA ESTRUCTURA MOLECULAR
Enviado por Daniel Díaz Blanco • 26 de Julio de 2019 • Apuntes • 15.932 Palabras (64 Páginas) • 234 Visitas
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Tabla de contenido
AGUA 4
ESTRUCTURA MOLECULAR 4
Enlaces no covalentes 4
Interacciones iónicas 4
Enlaces de Hidrógeno 4
Fuerzas de Van Der Waals 5
PROPIEDADES TERMIACAS DEL AGUA 5
PROPIEDADES SOLVENTES DEL AGUA 5
Moléculas hidrófilas y estructuración del agua molecular 6
AGUA ESTRUCTURADA 6
Moléculas hidrófobas y efecto hidrófobo 6
Moléculas anfipáticas 6
PRESIÓN OSMÓTICA 7
IONIZACION DEL AGUA 7
ÁCIDOS Y BASES 8
Conceptos PH y PKa 8
Amortiguadores 9
Capacidad amortiguadora 9
Ecuación de HENDERSON-HASSELBALCH 9
Ácidos débiles con más de un grupo ionizable 9
Amortiguadores fisiológicos 10
FISICOQUÍMICA Y BIOENERGÉTICA 11
TERMODINÁMICA 11
Primera ley de la termodinámica 12
Segunda ley de la termodinámica 12
Energía libre 13
Variaciones de la energía libre estándar 14
Compuestos celulares de alta energía 14
AMINOÁCIDOS 15
Estructura 15
Los aminoácidos tienen características estructurales comunes 16
Los aminoácidos no estándar tienen también importantes funciones 18
Los aminoácidos pueden actuar como ácidos y como bases 19
Los aminoácidos tienen curvas de titulación características 19
Formación de enlaces peptídicos 19
RESUMEN 19
PROTEÍNAS 20
ESTRUCTURA PRIMARIA 22
ESTRUCTURA SECUNDARIA 22
La hélice α es una estructura secundaria frecuente en las proteínas 22
La conformación β organiza las cadenas polipeptídicas en forma de hoja 24
Los giros β son frecuentes en las proteínas 24
Las estructuras secundarias comunes tienen ángulos diedros característicos 24
Las estructuras secundarias comunes pueden evaluarse mediante dicroísmo circular 25
ESTRUCTURAS TERCIARIA 25
ESTRUCTURA CUATERNARIA 26
TÉCNICAS BÁSICAS DE CARACTERIZACIÓN DE PROTEÍNAS: CROMATOGRAFÍA Y ELECTROFORESIS 27
CROMATOGRAFIA 27
Cromatografía de intercambio iónico 27
Cromatografía sobre papel 28
Cromatografía de filtración por gel 29
Cromatografía de afinidad 29
Otras técnicas cromatográficas 29
ELECTROFORESIS 30
Electroforesis sobre papel 30
Electroforesis en gel 30
ENZIMAS 31
PROPIEDADES: energía de activación, estado de transición, sitio activo 31
Cinética enzimática 33
Cinética Michaeliana ó cinética de Michaelis-Menten 33
Inhibición enzimática 34
Regulación enzimática 34
ÁCIDOS NUCLEICOS 36
Composición 36
Estructura 38
CARBOHIDRATOS 41
MONOSACÁRIDOS 41
Estructura cíclica de los monosacáridos 42
Reacciones de los monosacáridos 43
Monosacáridos importantes 45
Derivados monosacáridos 45
DISACÁRIDOS 45
POLISACÁRIDOS 46
GLUCÓLISIS 52
Reacciones de la vía glucolítica 54
Energética de la glucólisis 58
Regulación de la glucólisis 58
AGUA
ESTRUCTURA MOLECULAR
Está formada por dos átomos de Hidrógeno y uno de Oxígeno unidos entre sí por un enlace covalente sencillo. Tiene una geometría tetraédrica ya que el Oxígeno tiene una hibridación sp3.
La distribución electrónica de los enlaces O-H se desplaza hacia el Oxígeno y por lo tanto el enlace es polar. Moléculas como el agua en las que la carga está separada se denominan dipolos. Dada la gran diferencia de electronegatividad (capacidad de un átomo para atraer a los electrones, cuando forma un enlace químico en una molécula) entre el Hidrógeno y el Oxígeno, los hidrógenos con diferencia de electrones de una molécula de agua son atraídos hacia el par de electrones sin compartir de otra molécula de agua. Esta interacción es llamada enlace de Hidrógeno o puente de Hidrógeno. El enlace tiene tanto carácter electrostático (iónico) como covalente. Las interacciones electrostáticas ocurren entre dos cargas cualquiera, parciales opuestas (moléculas polares) o cargas totalmente opuestas (iones o moléculas con carga). Los enlaces covalentes implican la distribución compartida de electrones con superposición o mezcla de orbitales.
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