¿Dónde está la ecología en ecología molecular?
Elis ContrerasApuntes15 de Noviembre de 2019
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¿Dónde está la ecología en ecología molecular?
Las técnicas moleculares han tenido un profundo impacto en la biología. Principales disciplinas, incluida la biología evolutiva, ahora utilizar sistemáticamente las herramientas moleculares. En contraste, las técnicas moleculares han tenido un impacto más limitado en la ecología. Está La discrepancia es sorprendente. Aquí, describimos la inesperada escasez de investigaciones ecológicas en el campo referido coloquialmente. a como 'ecología molecular'. Publicaciones en los últimos 15 años de las revistas Ecología, Evolución y Ecología Molecular. revelan que gran parte de la investigación publicada bajo el estandarte de la ecología molecular es de hecho de naturaleza evolutiva, y que comparativamente poca investigación ecológica incorpora herramientas moleculares. Este fracaso para utilizar más ampliamente molecular Las técnicas en ecología son alarmantes porque varias líneas prometedoras de investigación ecológica podrían beneficiarse de la energía molecular. enfoques. Aquí resumimos el uso de herramientas moleculares en ecología y evolución, y sugerimos varias formas de renovar el enfoque ecológico en la ecología molecular.
El progreso en la ciencia casi siempre está moldeado por las herramientas. A disposición de sus practicantes. Microscopios, computadoras, y varios otros avances tecnológicos han profundizado influyó en la forma en que los científicos modernos se forman e intentan responder a sus preguntas más fundamentales (Burke et al. 1992, Queller et al. 1993, Amos 2000. Curiosamente, una vez Las herramientas de investigación se convierten en un lugar común, alternativas a lo común. La aplicación de estas herramientas es frecuentemente resistida (Kuhn 1962, Hung 2006). En las últimas tres décadas molecular las técnicas genéticas se han vuelto cada vez más importantes para biólogos, particularmente por la variedad de herramientas moleculares aumentado. Sin embargo, la utilización de técnicas moleculares. varía mucho entre las disciplinas biológicas. En ninguna parte es esto discrepancia más pronunciada que entre los campos de Biología evolutiva y ecología. Enfoques moleculares ahora impregnan la biología evolutiva: de hecho, algunos evolutivos Las disciplinas están casi completamente ligadas a los moleculares. enfoques (por ejemplo, la sistemática filogenética y filogeografía. Por el contrario, varias disciplinas en ecología en gran medida han pasado por alto las técnicas moleculares, incluso cuando la utilización de enfoques moleculares podría ayudar a resolver algunos de nuestros problemas ecológicos más interesantes.
La actual división molecular entre ecología y la evolución es desconcertante. Aunque ciertas líneas de ecológicas la investigación parece ser más adecuada que otras para el uso de enfoques moleculares, estamos convencidos de que más atención. Enfocado por los ecólogos en la incorporación de moleculares las técnicas podrían mejorar la investigación ecológica. Aquí nosotros recordar a los lectores la amplitud original del campo de Ecología molecular y demostrar cómo este campo ha especializarse inesperadamente, alejándose de un el énfasis ecológico general y hacia un estrecho una filogenética donde los marcadores moleculares sirven principalmente como trazadores históricos. Abogamos por un renovado esfuerzo por restaurar el componente ecológico de la ecología molecular, y nosotros demostrar el valor potencial de este cambio al señalar algunas cuestiones fundamentales en ecología que podrían beneficiar desde una perspectiva molecular.
El nombre inapropiado de la ecología molecular
Cuantificar el uso de técnicas moleculares en ecología y la biología evolutiva puede decirnos mucho sobre cómo el campo de la ecología molecular se ha desarrollado desde su inicio.
Lo que realmente queremos saber es el grado en que los modernos ecología molecular aborda problemas ecológicos versus problemas evolutivos. Sin embargo, esto primero requiere delinear límites disciplinarios entre la ecología y evolución. Estos son típicamente vistos como campos aliados, a menudo complementarios en sus hallazgos, pero desde nuestra perspectiva claramente distinto en el enfoque. Considerando que la ecología examina patrones y procesos que sustentan la distribución y abundancia. de organismos en sus ambientes (Ricklefs y Miller 1999), biología evolutiva explora cómo las características de
Las poblaciones cambian a través del espacio y el tiempo, incluyendo entender el papel de los factores ambientales y genéticos. En la conformación de patrones de biodiversidad (Futuyma 2005). Por lo tanto, Podemos usar estas amplias definiciones para explorar la aplicación. De los métodos moleculares en cada disciplina.
Intuitivamente, el término "ecología molecular" podría echar una red sobre cualquier área focal en la ecología donde las herramientas moleculares Se utiliza para abordar cuestiones ecológicas fundamentales. Sin embargo, Hay un sentimiento creciente entre los ecologistas de que la mayoría la investigación actual se lleva a cabo en el marco de la molecular Oikos 118: 1601 1609, 2009 doi: 10.1111 / j.1600-0706.2009.17557.x, # 2009 Los autores. Recopilación diario # 2009 Oikos Editor de la asignatura: Pia Mutikainen. Aceptado el 11 de mayo de 2009 1601 la bandera de la ecología no es de naturaleza ecológica. Más bien, La ecología molecular contemporánea es vista como siendo preocupado en gran medida por el campo evolutivo de la filogeografía.
Este sesgo puede deberse a varios factores, pero hay una percepción creciente que tiene la ecología molecular moderna. Poco que ver con problemas ecológicos fundamentales. Esta idea se refuerza por el sentido de que muchos estudios publicados en las revistas dedicadas a la ecología molecular son evolutivas en enfoque, y que hay pocos estudios de base molecular en problemas ecológicos siendo publicados en el núcleo ecológico. revistas Aquí, exploramos la validez de estas percepciones. Preguntamos: ¿dónde está la ecología en el campo de la molecular? ¿ecología?.
Para abordar esta cuestión, examinamos el uso de Herramientas moleculares en los últimos quince años en tres. Revistas representativas de Ecología, Evolución y Molecular. Ecología. Como revistas básicas en sus respectivos campos, estos Es probable que las publicaciones capten la amplitud de los investigación llevada a cabo en diversas subdisciplinas de Ecología y biología evolutiva. Para adquirir un cuantitativo.instantánea del grado en que la evolución y la ecología Utilizamos herramientas moleculares, caracterizamos los artículos publicados en.
Volúmenes recientes (años impares, 1993 2007). Nosotros particionamos estos campos en 13 subdisciplinas (Tabla 1): las seis primeras son campos ecológicos tomados de las principales categorías utilizadas para clasificar presentaciones en recientes reuniones anuales de la
Sociedad Ecológica de América; los siete restantes son campos evolutivos tomados de las principales categorías en general. Se utiliza para clasificar presentaciones en la sociedad conjunta. reuniones de la Sociedad para el Estudio de la Evolución, la Sociedad Americana de Naturalistas y la Sociedad de biólogos sistemáticos. Notamos que algunas de estas subdisciplinas compartir más superposición que otros. Por ejemplo, La ecología de la población y la genética de la población se centran en Tendencias demográficas, pero hacerlo en diferentes escalas de tiempo. Casos ambiguos en nuestro conjunto de datos fueron raros y fueron resueltos. Basado en el contexto de las preguntas que buscaban responder.
Luego examinamos el uso proporcional de las herramientas moleculares. en cada una de estas subdisciplinas, medida como el número de Papeles que utilizaron técnicas moleculares divididas por el total. Número de papeles. Documentos de las tres revistas focales de todos los años se combinaron, proporcionando así una visión amplia de uso de herramientas moleculares por disciplina. Los resultados son claros:
Las herramientas moleculares se utilizan con poca frecuencia en ecología en relación con
Biología evolutiva (fig. 1). Solo ecología del comportamiento. (con una proporción de 0.28) clasificado en la mitad superior de todos subdisciplinas combinadas, mientras que cuatro de las cinco restantes Campos ecológicos clasificados en la parte inferior de todas las subdisciplinas. Curiosamente, tres campos evolutivos de la filogeografía, La sistemática y la especiación realmente utilizan herramientas moleculares en la mayoría de sus trabajos publicados.
También examinamos las tendencias del uso de herramientas moleculares en El tiempo tanto en la ecología como en la biología evolutiva (fig. 2). Nuevamente, combinamos publicaciones de las tres revistas; También combinamos subdisciplinas, lo que nos permite comparar
Las dos amplias categorías de ecología versus biologia evolutiva. Encontramos que el uso de herramientas moleculares en estos Dos campos se han mantenido relativamente constantes en proporción. A lo largo del tiempo, con un modesto incremento en ambos campos en 2005.
seguido de una ligera disminución en 2007.
En general, los estudios ecologicos incorporan herramientas moleculares en una proporción de 0.12; Los estudios evolutivos lo hacen en una proporción de 0.55. Por lo tanto, Parece que la falta de uso de herramientas moleculares en ecología no es simplemente debido al tiempo insuficiente para que estas técnicas 'hacerse popular'.
Finalmente, examinamos cuál de las tres revistas focales eran más propensos a publicar de base molecular ecológica estudios y que eran en su mayoría propensos a publicar de base molecular Estudios evolutivos (fig. 3). No en vano, la mayoría de los artículos publicados en la revista Ecología fueron De carácter ecológico y más en la revista Evolución. Abordar los problemas evolutivos, aunque algunas ediciones cruzadas. ocurre. Lo sorprendente fue cuán pocos de los Papeles ecológicos publicados en ecología utilizan herramientas moleculares;
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