Producto Integrador primer parcial Bioinformática y Programación

UNIVERSIDAD AUTONOMA DE NUEVO LEON[pic 1][pic 2]

Producto Integrador primer parcial Bioinformática y Programación

Alumno:                               Gpo:                      Matrícula:

Para cada uno de los siguientes accesion number:

M21136

U49742

• En Genbank:

M21136

• Identificar el nombre del gen.
  tetracycline resistance (tetM) gene
• La longitud en pares de bases del gen. 
  2900 bp
• El organismo del cual se obtuvo el gen.
  Staphylococcus aureus
• Indique si es DNA genómico o extragenómico.
  Genómico
• ¿Cuál de ellos contiene exones y cuantos exones?
  Este no tiene exones
• ¿Por qué el otro gen no contiene exones?

Porque no se está utilizando el RNA mensajero

U49742

• Identificar el nombre del gen.
  Human rhodopsin gene
• La longitud en pares de bases del gen. 
  6953 bp
• El organismo del cual se obtuvo el gen.
  Homo sapiens
• Indique si es DNA genómico o extragenómico.
  Genómico
• ¿Cuál de ellos contiene exones y cuantos exones?
  tiene 5 exones (295...655,2439...2607,3813...3978,4095...4334,5168...5278)

• En Uniprot:

M21136

• Indicar el accesion number que da Uniprot.

Q53770

• Identificar en que parte de la célula se encuentra la proteína.

No se encuentra en una parte específica de la célula.

• En el apartado de Pathol/Biotech; indicar si está relacionada a una enfermedad.
  No se relaciona con una enfermedad.
• Indique las modificaciones postraducción que ocurren.
  No ocurren modificaciones.
• La longitud de la proteína.
  639
• La masa molecular de la proteína.
   72,639

U49742

• Indicar el accesion number que da Uniprot.
  P08100
• Identificar en que parte de la célula se encuentra la proteína.
  Membrane
• En el apartado de Pathol/Biotech; indicar si está relacionada a una enfermedad.
  Retinitis pigmentosa 4 (RP4)
• Indique las modificaciones postraducción que ocurren.
  [pic 3]
• La longitud de la proteína.

348

• La masa molecular de la proteína.
  38,893

Realice una búsqueda en BLAST para identificar el organismo que tenga el gen con mayor parecido al que se le proporcionó. Un BLAST para cada accession number proporcionado. Indique el porcentaje de similitud con cada uno de ellos y el E-value. Muestre una captura de pantalla con la alineación que escogió.

• S.aureus tetracycline resistance (tetM) gene, complete cds--- Staphylococcus aureus strain M92, complete genome: Porcentaje de similitud 99% y E-value: 0.0

[pic 4]

U49742

• Human rhodopsin gene, complete cds---MACACA MULATTA BAC clone CH250-336F22 from chromosome 11, complete sequence Porcentaje de similitud 93% y E-value: 0.0

[pic 5]

En PubMed, realice una búsqueda de literatura científica de algún tema que le sea de interés y escoga tres artículos o review. Léalos y con sus palabras (1 cuartilla) explique cuál es el la información que haya captado de los textos que leyó. Ponga las fuentes utilizadas en formato APA. No es necesario que entienda al 100% la información, solo la idea principal. Algunas opciones de temas a buscar:

• Vacunas comestibles.
• Biorremediación de suelos y agua.
• Producción de anticuerpos.
• Células madre.
• Clonación.
• Cultivos genéticamente modificados.

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