CRITERIOS PARA LA ELABORACIÓN DE UN PROTOCOLO

Universidad de Guadalajara[pic 1]

Centro Universitario de la Ciénega

Posgrado en Ciencias

II. CRITERIOS PARA LA ELABORACIÓN DE UN PROTOCOLO

Protocolo: Se le denomina protocolo o proyecto de investigación a un documento que contiene el plan de trabajo que se programa realizar para la elaboración de un trabajo recepcional. En este documento se presentarán los siguientes apartados:

1. Portada: donde se expresará el tema o título a tratar, el autor (alumno) así como el responsable (director o asesor) del mismo, la Institución, el programa de posgrado y la fecha de presentación.

2. Antecedentes: En este se incluye el llamado "marco teórico" o "estado del arte" del tema de investigación, procurando que la información presentada -en un orden lógico de ideas- lleve al lector a comprender el planteamiento del problema y la importancia de realizar el proyecto.

3. Justificación: En esta parte se busca demostrar la necesidad e importancia de solucionar un problema. Para lo cual deben señalarse las razones que motivaron la selección del problema de investigación y la importancia de la solución del problema de investigación (social, científica o tecnológica).

4. Planteamiento del problema: Representa el punto de partida de la investigación. Aquí se deberá hacer explícito el tema a tratar en forma de problema, es decir, exponiendo su existencia como una insuficiencia, obstáculo o carencia. En su exposición hay que incluir una o más preguntas, las cuales deberán ser contestadas a lo largo de la investigación.

5. Hipótesis.  Es una respuesta tentativa que se da a la pregunta o preguntas que se formulan en el planteamiento del problema y que se tienen que demostrar  en el transcurso de la investigación.

6. Objetivos: Representan una de las partes fundamentales de cualquier estudio, ya que son los puntos de referencia o señalamientos que guiarán su desarrollo, a cuyo logro se dirigen todos los esfuerzos.

Para su presentación, los objetivos pueden dividirse en generales, particulares o específicos. En lo que respecta al objetivo general, debe plantearse a grandes rasgos los resultados que se quieren alcanzar a través de la investigación. Mientras que los particulares o específicos, señalan cada una de las etapas a alcanzar en el logro del objetivo general.

Es importante verificar la CONGRUENCIA entre el titulo, justificación, planteamiento del problema, objetivos e hipótesis.

7. Materiales y Métodos: En esta parte del proyecto, se describen y justifican los materiales, métodos y técnicas de investigación a utilizar. Indicar el tipo de estudio y -cuando aplique- el tipo de muestras a analizar, fórmula empleada para estimar el tamaño de muestra,  los criterios de inclusión y exclusión, aspectos éticos, y análisis estadístico.

Es recomendable incluir un diagrama de flujo que esquematice el orden de técnicas que se aplicarán para obtener el conocimiento planteado.

8. Bibliografía: aquí se anotan los datos que permiten identificar las fuentes documentales a utilizar en el desarrollo del proyecto en un formato homogéneo (ver ejemplo). NOTA: Se requiere citar un mínimo de 15 fuentes.

9. Cronograma: Representa la descripción gráfica del tiempo a utilizar en la realización el proyecto (la tesis), el cual, para el caso que nos ocupa, se dividió en tres etapas:

10. AVANCES: Este apartado se incluye hasta el segundo o inclusive tercer semestre cuando el protocolo se presenta en los coloquios de investigación.

Para que el protocolo sea presentado en los coloquios de investigación, es requisito entregarlo o enviarlo por e-mail a los integrantes de su comité de seguimiento una semana antes para que lo puedan evaluar.

NOTA GENERAL SOBRE ESTA PLANTILLA DE PROTOCOLO DE TESIS: La estructura de esta plantilla concuerda con un reporte científico básico y no con un autor o revista científica particular. Son aceptadas variantes a este formato con visto bueno del director de tesis y comité de seguimiento, siempre y cuando se cuide la homogeneidad y la claridad de las ideas a transmitir, pensando en un público que conoce del área pero que no es experto en el tema particular de tesis.  

ABAJO EJEMPLO ILUSTRATIVO

Centro Universitario de la Ciénega

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PROGRAMA DE DOCTORADO EN CIENCIAS

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PROTOCOLO DE TESIS

“ORÍGENES ANCESTRALES DE POBLACIONES MESTIZAS DE MÉXICO MEDIANTE EL ANÁLISIS DE Y-SNPs y mtSNPs”

PRESENTA:

QFB. Gabriela Martínez Cortés

DIRECTOR DE TESIS:

Dr. en C. Héctor Rangel Villalobos

COLABORADORES:

QFB. Rodrigo Rubí Castellanos

Sede: Laboratorio de Genética Molecular, Centro Universitario de la Ciénega (CUCI-UdeG)

Financiamiento: CONACyT Ciencia Básica 2009 (N°25925)

ANTECEDENTES

Generalidades del CY y mtDNA.

El cromosoma Y (CY) y el genoma mitocondrial (mtDNA), constituyen una herencia paterna y materna, respectivamente. El CY se compone de alrededor de 50 Mb de DNA y posee alrededor de 50 genes. Su mayor parte es heterocromatina constitutiva, inerte desde el punto de vista genético. Sin embargo, cabe señalar que muchos de los genes en la porción no recombinante del CY participan en la espermatogénesis y determinación del sexo (Strachan y Read, 2004). Por su parte, el genoma mitocondrial es una molécula circular de doble cadena, cada una con una composición de bases diferente, la cadena pesada (H) rica en guaninas y la cadena ligera (L) rica en citosinas, consta de aproximadamente 16,5 Kb (Figura 1) y está localizada dentro de la mitocondria. Alrededor del 93% del mtDNA representa secuencias codificantes, contiene 37 genes que codifican 13 polipéptidos que son subunidades de enzimas de la fosforilación oxidativa (OXPHOS), dos tipos de RNA ribosómico y 22 ARN de transferencia (Strachan and Read 2004). Del resto del mtDNA que no codifica, la secuencia más importante por su variabilidad es la región control o D-Loop, que constituye 1122 pares de bases, el fragmento más largo de secuencia no codificante (Cann et al. 1987).

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A diferencia de los otros cromosomas, ni el mtDNA ni el CY recombinan durante la formación de los gametos en la meiosis; sólo existe una excepción en los extremos del CY (~3 Mb), conocidos como región pseudo-autosómica (PAR 1 Y 2) (Figura 2). El segmento mayor que escapa a este proceso se conoce como región no recombinante del CY (NRY), que se transmite de padres a hijos varones sin cambios, a excepción de las mutaciones nuevas que se acumulen de generación en generación, las cuales constituyen un registro evolutivo fácilmente interpretable (Rangel-Villalobos, 2006). De manera similar, el mtDNA muestra herencia materna debido a que las mitocondrias del cigoto son aportadas por el ovulo y ninguna por el espermatozoide. El óvulo es una célula gigante comparada con el espermatozoide, tiene una dotación aproximada de 250,000 mitocondrias. Durante la fecundación, la introducción de la cabeza del espermatozoide al óvulo, conteniendo el material genético nuclear del padre, supone la pérdida del cuello y cola del mismo junto con sus mitocondrias, con formación final del óvulo fecundado libre de mitocondrias paternas y abundante en maternas. Por esta razón, el CY y mtDNA son de gran utilidad para el estudio de las migraciones de poblaciones humanas al seguir los linajes directamente a través de las líneas paterna (CY) o materna (mtDNA). Mientras el cromosoma X y los autosómicos tienen múltiples ancestros debido a la recombinación, los mtDNA y CY modernos se infiere que provienen de un ancestro paterno y materno único, análogos a un “Adán y Eva” respectivamente (Jobling y Tyler-Smith, 1995).  

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Marcadores/Polimorfismos de los sistemas de herencia uniparental.

El análisis del registro evolutivo del CY y del mtDNA consiste en describir cambios o mutaciones, tanto entre individuos de la misma población como de distintas poblaciones, con el fin de observar similitudes y/o diferencias que permitan establecer el grado de relación entre individuos y poblaciones, respectivamente. Su descripción se basa en el análisis de polimorfismos o marcadores moleculares, de los cuales la mayor parte son sustituciones puntuales (SNPs), aunque también se han descrito inserciones/deleciones de una o varias pares de bases (indel). Estos marcadores bialélicos, que en general describiremos en este trabajo como Y-SNPs (marcadores del CY) y mtSNPs (marcadores del mtDNA), proveen de una herramienta adicional en las metodologías de la identificación humana y análisis evolutivo. El análisis de Y-SNPs en la región no recombinante del CY y mtSNPs ha proporcionado una alta resolución en el estudio de la historia de poblaciones humanas a través de la reconstrucción de relaciones filogenéticas del CY y mtDNA (Cavalli-Sforza et al. 2004).

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