Control De Lectura Nº1: New letters for life’s alphabet

Control De Lectura Nº1: New letters for life’s alphabet

Grupo 3 

1)    Defina lo que los autores llaman el “alfabeto de la vida” y explique brevemente lo que los autores quieren decir cuando menciona que el alfabeto es universal pero parece ser un accidente de la historia más que una necesidad funcional. 

Los autores definen el “alfabeto de la vida” como las bases nitrogenadas que se encuentran en los ácidos nucleicos, los cuales forman las cadenas de códigos existentes en el ADN. Estas bases son denominadas como: Adenina, Timina, Guanina, Citosina y Uracilo. En las dobles hélices de los ácidos nucleicos se forman estas bases pero de forma pareada, es decir, Guanina con citosina y adenina con timina.  Estas, en sus secuencias se determina como se almacena la información genética, por lo cual forman un papel importantísimo y crucial. Los autores mencionan que es un gran accidente de la historia debido a que ciertas pares de bases han sido sintetizadas en laboratorio (in vitro) y procesadas por enzimas. A su vez, dicen que es universal, ya que es la forma de transmisión y almacenamiento de material genético, de todos los seres vivos existentes.

2)    Al mencionar el trabajo realizado por Malyshev et al 2014 los autores recalcan que la producción de un organismo capaz de utilizar otras bases nitrogenadas presenta 2 complicaciones. Mencione y explique cómo solucionaron esas 2 problemáticas

La primera complicación consistía  en encontrar una manera de hacer que la bacteria absorbiera nucleótidos no naturales. para resolver este problema Malyshev y sus colegas diseñaron una cepa de Escherichia Coli que expresa una proteína transportadora de nucleótidos trifosfato de algas, que permitía la importación directa de los nucleótidos d5SICS y dNaM 

La segunda complicación consistía en lograr trabajar con las limitaciones propias de las polimerasas que sintetizan los polímeros de los ácidos nucleicos. Lo que hicieron para asegurar una replicación eficiente, los autores colocaron el par de bases no naturales en una región de plásmido que se predice que será replicado únicamente por la ADN polimerasa I.

3)    Los autores de este News & Letters presentan la investigación de Malyshev et al. 2014 y luego presenta trabajos a futuro que permitirían generar un organismo semi-sintético 100% funcional. Mencione hasta donde llegó la investigación de Malyshev y colaboradores y luego mencione los pasos a seguir que plantean Ross Thyrer y Jared Ellefson para llegar a ampliar el alfabeto de la vida. 

Demostraron la presencia del par de bases no naturales en plásmidos recuperados. Se estimó que la retención del par de bases no naturales después de 15 horas de crecimiento celular y replicación del plásmido era al menos del 99,4% por duplicación del mismo. El siguiente paso será asegurar la retención a largo plazo, lo que puede requerir la ingeniería de una bacteria que depende del par de bases no naturales. Una vez que los pares de bases no naturales no sólo son tolerados por un organismo, sino que también son aceptados y utilizados, el siguiente paso crucial será demostrar que pueden transcribirse a ARN in vivo.

4)    Al final del escrito los autores plantean que, si el mecanismo de Malyshev funciona para incorporar un par de letras, esto podría usarse para aumentar el número de letras que se puedan incorporar al alfabeto de la vida. Mencione las preguntas fundamentales que los autores mencionan a partir de la posibilidad de generar organismos semi-sintéticos utilizando esta técnica. Entregue una opinión como grupo de las posibles implicancias éticas de este tipo de manipulaciones. 

Las preguntas mencionadas por los autores son; ¿Por qué detenerse en solo 6 letras? y en caso de poder sumar otro par en E. Coli, ¿ Por qué es que la vida se basa en sólo 2 pares?Otra pregunta que mencionan es si es que los organismos semisintéticos con la capacidad de almacenar información tendrán las capacidades de expandirse o de soportar este aumento de capacidad.

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